Curso Gratis de Secuenciación del Genoma por la Universidad de California San Diego

El genoma es la sucesión total de ADN que tiene un organismo en especial. El genoma en eucariontes comprende el ADN contenido en el núcleo celular, organizado en cromosomas, y el genoma de orgánulos celulares, como las mitocondrias y los plastos.

En cuanto al genoma eucariota, se examina en caso de que la célula vaya a someterse a un proceso de cariocinesis; si hablamos de la interfase del periodo celular, el nivel de compactación de la cromatina es menor, lo cual posibilita la replicación del material genético.

Los organismos diploides poseen 2 copias del genoma en sus células, gracias a la existencia de pares de cromosomas homólogos.

La secuenciación del genoma de una especie no examina la pluralidad genética o el polimorfismo de los genes.



Sobre el Curso (Por la Plataforma)

Es posible que haya escuchado mucho sobre la secuenciación del genoma y su potencial para marcar el comienzo de una era de medicina personalizada, pero ¿qué significa secuenciar un genoma?

Los biólogos aún no pueden leer los nucleótidos de un genoma completo como lo harían con un libro de principio a fin. Sin embargo, pueden leer fragmentos cortos de ADN.

En este curso, veremos cómo se puede usar la teoría de grafos para ensamblar genomas a partir de estas piezas cortas. Aprenderemos más sobre los algoritmos de fuerza bruta y los aplicaremos a la secuenciación de miniproteínas llamadas antibióticos.

En la primera mitad del curso, veremos que los biólogos no pueden leer los 3 mil millones de nucleótidos de un genoma humano como lo harían con un libro de principio a fin. Sin embargo, pueden leer fragmentos más cortos de ADN.

En este curso, veremos cómo se puede usar la teoría de grafos para ensamblar genomas a partir de estas piezas cortas en lo que equivale al rompecabezas más grande que jamás se haya armado.

En la segunda mitad del curso, hablaremos sobre los antibióticos, un tema de gran relevancia dado que las bacterias resistentes a los antimicrobianos como el MRSA están en aumento.

Los antibióticos son medicamentos, pero a nivel molecular son miniproteínas cortas que han sido diseñadas por bacterias para matar a sus enemigos.

Determinar la secuencia de aminoácidos que componen uno de estos antibióticos es un importante problema de investigación, y es similar a la secuenciación de un genoma ensamblando pequeños fragmentos de ADN.

Veremos cómo los algoritmos de fuerza bruta que prueban todas las soluciones posibles pueden identificar antibióticos naturales para que puedan sintetizarse en un laboratorio.

Finalmente, aprenderá a aplicar herramientas de software de bioinformática populares para secuenciar el genoma de una bacteria Staphylococcus mortal que ha adquirido resistencia a los antibióticos.

Habilidades que obtendrás

  • Algoritmos
  • Programación Python
  • Secuenciación del genoma completo
  • Programación dinámica

Detalles del Curso

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Nivel

Este curso es para principiantes.

Duración

La duración aproximada para este curso es te 17 horas para completar.

Idioma

Inglés (English)

Subtítulos: Árabe (Arabic), Francés (French), Portugués (europeo), Italiano, Portugués (de Brasil), Vietnamita, Alemán (German), Ruso (Russian), Inglés (English), Español (Spanish)

Instructores

  • Pavel Pevzner – Profesor
  • Felipe Compeau – Investigador Visitante

Ofrecido por

Universidad de California en San Diego

UC San Diego es una potencia académica y un motor económico, reconocida como una de las 10 mejores universidades públicas por US News and World Report. La innovación es fundamental para lo que somos y lo que hacemos. Aquí, los estudiantes aprenden que el conocimiento no solo se adquiere en el salón de clases, la vida es su laboratorio.

Programa (Semanas)

1: Introducción a la secuenciación del genoma

  • Videos: 8
  • Duración: 36 Minutos
  • Lecturas: 2
  • Cuestionarios: 3
  • Horas para completar: 4

2: Aplicación del teorema de Euler para ensamblar genomas

  • Videos: 5
  • Duración: 28 Minutos
  • Lecturas: 1
  • Cuestionarios: 3
  • Horas para completar: 3

3: Secuenciación de antibióticos

  • Videos: 5
  • Duración: 27 Minutos
  • Lecturas: 1
  • Cuestionarios: 3
  • Horas para completar: 4

4: Del espectro ideal al real para la secuenciación de antibióticos

  • Videos: 4
  • Duración: 18 Minutos
  • Lecturas: 1
  • Cuestionarios: 3
  • Horas para completar: 3

Semana 5: ¡Desafío de aplicación de bioinformática!

¡Bienvenidos a la semana 5 de clase!

Esta semana, veremos cómo aplicar las herramientas de ensamblaje del genoma a los datos de secuenciación de una peligrosa bacteria patógena.

Preguntes Frecuentes

¿Cuándo podré acceder a las lecciones y tareas?

El acceso a las clases y las asignaciones depende del tipo de inscripción que tengas. Si tomas un curso en modo de oyente, verás la mayoría de los materiales del curso en forma gratuita. Para acceder a asignaciones calificadas y obtener un certificado, deberás comprar la experiencia de Certificado, ya sea durante o después de participar como oyente. Si no ves la opción de oyente:

  • Es posible que el curso no ofrezca la opción de participar como oyente. En cambio, puedes intentar con una Prueba gratis o postularte para recibir ayuda económica.
  • Es posible que el curso ofrezca la opción ‘Curso completo, sin certificado’. Esta opción te permite ver todos los materiales del curso, enviar las evaluaciones requeridas y obtener una calificación final. También significa que no podrás comprar una experiencia de Certificado.

¿Qué recibiré si me suscribo a este Programa especializado?

Cuando te inscribes en un curso, obtienes acceso a todos los cursos que forman parte del Programa especializado y te darán un Certificado cuando completes el trabajo.

Se añadirá tu Certificado electrónico a la página Logros. Desde allí, puedes imprimir tu Certificado o añadirlo a tu perfil de LinkedIn.

Si solo quieres leer y visualizar el contenido del curso, puedes auditar el curso sin costo.

¿Hay ayuda económica disponible?

Sí. En ciertos programas de aprendizaje, puedes postularte para recibir ayuda económica o una beca en caso de no poder costear los gastos de la tarifa de inscripción.

Si hay ayuda económica o becas disponibles para tu selección de programa de aprendizaje, verás un enlace para postularte en la página de descripción.



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